Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Psmb7P70195 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psmb7P70195 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms