Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Acta1P68134 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acta1P68134 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms