Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Barhl1P63157 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms