Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kcnab1P63143 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnab1P63143 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms