Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3cP62823 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3cP62823 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms