Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Vsnl1P62761 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vsnl1P62761 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsnl1P62761 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms