Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acta2P62737 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acta2P62737 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acta2P62737 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms