Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab11aP62492 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11aP62492 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms