Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arf6P62331 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms