Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpd1P62315 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms