Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps11P62281 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rps11P62281 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms