Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnd3P61588 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms