Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Depdc5P61460 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Depdc5P61460 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Depdc5P61460 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Depdc5P61460 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Depdc5P61460 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Depdc5P61460 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Depdc5P61460 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms