Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smg6P61406 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Smg6P61406 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms