Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ActbP60710 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ActbP60710 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ActbP60710 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ActbP60710 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ActbP60710 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ActbP60710 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ActbP60710 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ActbP60710 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ActbP60710 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms