Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcmtd1P59913 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcmtd1P59913 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcmtd1P59913 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms