Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps33bP59016 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps33bP59016 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vps33bP59016 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms