Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rhbdl3P58873 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rhbdl3P58873 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms