Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tpm2P58774 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tpm2P58774 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms