Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P58686 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P58686 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P58686 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P58686 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P58686 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P58686 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P58686 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms