Protein–RNA interactions for Protein: P58682

Tlr8, Toll-like receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr8P58682 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tlr8P58682 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tlr8P58682 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tlr8P58682 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms