Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxbp1P58501 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms