Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctdsp1P58466 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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