Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Strn4P58404 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Strn4P58404 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn4P58404 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Strn4P58404 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Strn4P58404 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Strn4P58404 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms