Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lim2P56563 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms