Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gp1bbP56400 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gp1bbP56400 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms