Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp5P56399 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp5P56399 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp5P56399 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp5P56399 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms