Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cks2P56390 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cks2P56390 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cks2P56390 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cks2P56390 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms