Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcd3P55096 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Abcd3P55096 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms