Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rad23aP54726 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms