Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PitpnbP53811 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PitpnbP53811 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms