Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fdft1P53798 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms