Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HccsP53702 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HccsP53702 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HccsP53702 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HccsP53702 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HccsP53702 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HccsP53702 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HccsP53702 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HccsP53702 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HccsP53702 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms