Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cux1P53564 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux1P53564 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cux1P53564 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms