Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec1P51908 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec1P51908 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms