Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpc4P51655 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms