Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csrp3P50462 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csrp3P50462 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms