Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CenpcP49452 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpcP49452 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CenpcP49452 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms