Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd1P48410 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd1P48410 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms