Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VdrP48281 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VdrP48281 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VdrP48281 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VdrP48281 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VdrP48281 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VdrP48281 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VdrP48281 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms