Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gbx2P48031 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbx2P48031 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms