Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TgfaP48030 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TgfaP48030 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TgfaP48030 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms