Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gli1P47806 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gli1P47806 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms