Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SrprbP47758 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SrprbP47758 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrprbP47758 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrprbP47758 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrprbP47758 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SrprbP47758 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrprbP47758 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms