Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pax9P47242 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax9P47242 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms