Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cox6a1P43024 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cox6a1P43024 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms