Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-2P42586 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nkx2-2P42586 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nkx2-2P42586 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms