Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Etv1P41164 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms