Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ThpoP40226 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ThpoP40226 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ThpoP40226 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ThpoP40226 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ThpoP40226 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ThpoP40226 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms