Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Timp3P39876 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Timp3P39876 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Timp3P39876 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Timp3P39876 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms